Père décédé quand Clermont-Ganneau avait 5 ans.
1857 : Collège Sainte-Barbe
1862 : Lycée Louis-le-Grand (avec Gaston Maspero)
Suit des cours à l'École des langues orientales et au Collège de France (arabe, turc, persan, hébreu, épigraphie sémitique)
1867 : Licence classique
1867 : Drogmanat aux affaires étrangères
1876 : répétiteur en archéologie orientale
1878 : directeur d'études adjoint
1893 ou 1894 : directeur d'études
1867 : Drogman-chancellier au consulat de Jérusalem
1880 : Correspondant à l'Académie des Inscriptions et Belles-Lettres
1881 : Vice-consul de France à Jaffa
1889 : Membre de l'Académie des Inscriptions et Belles-Lettres
1890 : Élu au Collège de France à la chaire "Épigraphie et antiquités sémitiques", sur proposition d'Ernest Renan
Membre du service diplomatique de la France
Épigraphie sémitique (en particulier phénicienne, moabite, hébraïque, araméenne, punique, néo-punique, arabe), grecque et latine et papyrologie araméenne.
Les antiquités sémitique, Paris, 1890
Archaeological researches in Palestine during the years 1873-1874, Londres, Palestine Exploration Fund,1896, 1899
Études d'archéologie orientale, Paris, E. Bouillon, 1895-1896,
Rapports sur une mission en Palestine et en Phénicie entreprise en 1881, Paris, Imprimerie nationale 1882-1885
Recueil d'archéologie orientale, Paris, E. Leroux, 1888
Les travaux archéologiques en Syrie de 1920 à 1922, Paris, Geuthner, 1923
Les tombeaux de David et des rois de Juda et le tunnel-aqueduc de Siloé, Paris, Imprimerie nationale, 1897
La Palestine inconnue, Paris, E. Leroux 1886
Album d'antiquités orientales, Paris, E. Leroux 1897
Fondateur de la revue Syria
Louis Havet, « M. Clermont-Ganneau » , École pratique des hautes études, Section des sciences historiques et philologiques. Annuaire 1923-1924. 1923. p. 89-90.
René Dussaud, "Les travaux et les découvertes archéologiques de Charles Clermont-Ganneau (1846-1923)", Syria. Archéologie, Art et histoire 4/2 (1923), 140-173.
René Cagnat, " Notice sur la vie et les travaux de M. Ch. Clermont-Ganneau : lue dans la séance publique annuelle du 21 novembre 1924" Académie des Inscriptions et Belles-Lettres, Paris : Institut de France, 1924.
André Dupont-Sommer, « Un dépisteur de fraudes archéologiques : Charles Clermont-Ganneau (1846-1923), membre de l'Académie des Inscriptions et Belles-Lettres », Comptes rendus des séances de l'Académie des Inscriptions et Belles-Lettres Année 1974/4, p. 591-609