José Lothe a obtenu un baccalauréat philosophie obtenu en juillet 1960 (académie de Lille), puis le diplôme de l'EPHE (Sciences historiques et philologiques) en janvier 1977 et un doctorat de 3e cycle en mai 1986 à l'Université de Paris IV (Mention très bien).
José Lothe a été préparateur licencié à l'EPHE en 1977 et il est devenu maître de conférences en septembre 1996.
Par ailleurs, il a été élu conseiller municipal de Cobonne en mai 2011 et réélu conseiller en mars 2014 et élu maire le 30/03/2014.
Histoire des estampes.
Histoire de l'illustration des livres.
Les 1res estampes italiennes (en particulier Marc-Antoine Raimondi)
Les estampes françaises du XVIIe siècle.
Publication (en cours en 2017) des Notes manuscrites de Pierre-Jean-Mariette, marchand d'estampes et collectionneur parisien. Ces notes décrivent les estampes vendues au prince Eugène de Savoie et ont eu l'ambition de réunir l'ensemble des œuvres connues des graveurs européens depuis l'apparition des images imprimées.
- Images de confréries parisiennes, Paris, 1992, 304 p. (avec la collaboration d’Agnès Virole)
- L’œuvre gravé de François et de Nicolas de Poilly d’Abbeville, graveurs parisiens du XVIIe siècle, Paris, 1994. 389 p.
- Images de confréries, t. II, Paris, 1999, 227 p. (avec la collaboration d’Agnès Virole)
- La vie, les livres et les lectures de Pierre de L’Estoile. Nouvelles recherches. Préface d’Henri-Jean Martin. Paris, 2004, 1184 p. (En collaboration avec Florence Greffe). Cet ouvrage a reçu en 2005 le prix Le Senne décerné par l’Académie des Inscriptions et Belles-Lettres.
- Alphonse Leroy, graveur. 1820-1902, Paris, 2007, 256 p. (Avec la collaboration de Paul Guermonprez).
- Alphonse Leroy, graveur. 1820-1902, Paris, 2007, 256 p. (Avec la collaboration de Paul Guermonprez).
- L'œuvre gravé d'Abraham Bosse, graveur parisien du XVIIe siècle, Paris, 2008, 544 p. Cet ouvrage a obtenu en 2009 la 1re médaille du Concours national des Antiquités décernée par l'Académie des Inscriptions et Belles-lettres.