Elle est fille d'un médecin, spécialiste en médecine légale et du travail, et d'une mère enseignante dans les écoles primaires. Elle a trois frères, dont deux médecins et un avocat, résidant en Italie.
Elle s'est mariée en 1984 et a eu deux enfants.
Elle a été élève au Lycée Classique à Pesaro. En 1980, elle soutient une thèse de Laurea en Assyriologie à la Faculté de Langues et Littératures Orientales de l'Université de Venise (Ca'Foscari). En 1983, elle soutient une seconde thèse de Laurea en Histoire du Proche-Orient Ancien à la Faculté de Lettres, à l'Université de Rome (La Sapienza). Depuis 1983, grâce à une bourse du Ministère des Affaires Etrangères français, et ensuite du Ministère de l'Education Nationale italien, elle poursuit ses études à Paris, sous la direction de J. Bottéro et de P. Garelli, à l'Ecole Pratique des Hautes Etude, IVe section. En 1985, elle obtient le Diplôme d'Etudes Approfondies (DEA) en Histoire et civilisation de l'Antiquité, à l'Université de Paris I Panthéon-Sorbonne. En 1995, elle soutient une thèse de Doctorat conjoint Université de Paris IV-Sorbonne et Institut Catholique de Paris en Histoire des Religions - Philologie et Histoire des Religions de l'Orient.
Depuis octobre 2005, elle est directeur d'études à la chaire de Religions du monde syro-mésopotamien.
D'octobre 1998 à octobre 2005, elle a été chargée de Recherche de 1re Classe au CNRS et intégrée, de 1998 à 2004, à l’UMR 8140, Laboratoire URMED, "Réseaux urbains et structures rurales dans le Monde Méditerranéen et ses abords de l'Antiquité au Moyen-Âge" (Université de Versailles-Saint-Quentin-en-Yvelines). Depuis 2004, elle est membre de l'UMR (7119)/8167 Orient et Méditerranée, dans le Laboratoire des Etudes Sémitiques Anciennes du Collège de France.
En 2005, elle a été habilitée à diriger des recherches à l'Université Lumière Lyon 2, avec un Mémoire de synthèse intitulé "L'autre face de l'empire. Syriens et Assyriens dans le Moyen-Euphrate à l'Âge du Fer I-II. Politique et culture d'une colonie assyrienne du VIIIe siècle av. J.-C.".
Depuis 1987, chaque année, Maria Grazia Masetti-Rouault participe à des missions archéologiques sur les sites de Terqa-Ashara (1987-1998), à Tell Masaïkh depuis 2000, dans la vallée du Moyen-Euphrate (Syrie), et organise un programme de prospections et de sondages dans la même région. De 1990 à 1993, elle a été coordinatrice scientifique de l'exposition "L'Eufrate e il Tempo. Le Civiltà del medio Eufrate e della Gezira siriana" (environ 300 objets originaux provenant des régions du Moyen-Euphrate et de la Djézireh syrienne), Rimini, Italie. Elle a également été coéditeur du Catalogue.
Depuis 2000, elle dirige la Mission archéologique à Tell Masaikh en Syrie.
En 2004, elle a été professeur invitée à l'Université de Pavie (Italie). En 2004-2005, elle est devenue membre élu du Comité National de la Recherche Scientifique, dans la section 32, puis secrétaire scientifique de la section.
Principaux ouvrages :
- Cultures locales du Moyen-Euphrate. Modèles et événements, IIe-Ier millénaires av. J.-C., Subartu VIII, Brepols, Turnhout, 2001.
- Coéditeur, avec O. Rouault, du catalogue de l'exposition, L'Eufrate e il Tempo. Le Civiltà del medio Eufrate e della Gezira siriana, 485 pp., Electa, Milan, 1993.
- Coéditeur, avec O. Rouault, des Actes du Colloque International Après l'Empire: crise de l'État et de la Monarchie en Mésopotamie du Nord et en Anatolie (XIIIème-Xème siècles av. J.-C.), After the Empire : Crisis of the State and of the Monarchy in Northern Mesopotamia and in Anatolia (XIIIth-Xth centuries BC), Lyon 2003.
Articles :
- ""Pour le bien de mon peuple": continuité et innovation dans l'idéologie du pouvoir au Proche-Orient à l'âge du Fer", dans M. Mazoyer et O. Casabonne (éds.), Studia Anatolica et Varia. Mélanges offerts au Professeur René Lebrun, Kubaba Série Antiquité VI, Paris 2004, p.113-132.
- "Des dieux au service des hommes : Le fanatisme oriental, vu de la Mésopotamie ancienne", dans Penser/rêver 8 (2005), pp.127-142.
- "Le chantier F: étude générale préliminaire", en collaboration avec O. Rouault, B. Cifola, L. Doumenc et C. Di Salvatore, dans Mari, Annales de Recherche Interdisciplinaires (M.A.R.I.), 8 (1997), p.83-88.
- "Le sondage K1 du Chantier F", dans Mari, Annales de Recherche Interdisciplinaires (M.A.R.I.), 8 (1997), pp. 89-98.
- "Il cantiere E di Tell Masaïkh", dans O. Rouault et C. Mora (éds.) "Missione archeologica di Terqa-Ashara : rapporto preliminare 2000", Athenaeum. Studi di Letteratura e Storia dell’Antichità LXXXIX, 2 (2001), pp. 633-638.
- "Rapporto preliminare sui lavori della missione nel sito di Tell Masaïkh nel 2001 [-2005]", dans O. Rouault et C. Mora (éds.) "Il Progetto "Terqa e la sua regione (Siria): rapporto preliminare 2001", Athenaeum. Studi di Letteratura e Storia dell’Antichità LXXXIX, 2 (2002), p. 570-581 ; XCI, 2 (2003), p. 559-575; XCII (2004), pp. 536-544 ; XCIII (2005), p. 663-675 ; XCIII (2006), pp. 749-756 ; XCIII (2006), p.739-749.
- "Les fouilles de Tell Ashara-Terqa. Rapport préliminaire sur les travaux du chantier F de 1993-1994", Ah Purattim 1 (2007), pp. 45-60.
- "La céramique du chantier F de Terqa-Ashara", en collaboration avec P.Poli, Ah Purattim I (2007), pp. 63-111.
- "Mari et le Moyen-Euphrate au Bronze Récent et à l'Âge du Fer : problèmes historiques", Actes de la table ronde "Travaux récents sur et autour de Mari", Université de Strasbourg, UMR 7571, 20-21 juin 1997, Ah Purattim 1 (2007), pp. 281-300.